Его отец, великий и набожный человек, покойный атолла Хадж Шейх Мухаммад Хусейн Субхани Хиябани являлся одним из ученых и законоведов города Табриза.

   После окончания первоначального образования, он начинает изучать литературные тексты персидского языка в школе покойного Мирза Махмуд Фазил (сын Фазиля Мараги, который являлся одним из учеников великого Шейха Ансари) и там он изучил такие книги, как: Голестан, Бустан, Тарих Му¢джам, Нисаб ас-сибйан, Абваб аль-джинан и другие книги.

   Затем, в 14-ти летнем возрасте он поступает в научное медресе Табриза, где начинает изучать первоначальные религиозные науки и средний курс обучения.

   Литературные науки он изучает около таких покойных ученых, как: Хадж Шейх Хасан Нахви и Шейх Али Акбар Нахви и часть книг Мутаввал, Мантиг Манзума и толкование книги Лум¢а изучает у великого ученого Мирза Мухаммад Али Мударрис Хиябани, который являлся автором книги «Рийханат аль-адаб» и это время продлилось около 5 лет.

   В то время он хотя ему 17 лет пишет две книги, которые и сейчас существуют: 1 – «Ми'яр аль-фикр» (о логике); 2 – «Мухаззаб аль-балага» (о науках красноречия). В месяце Мехр 1325 года солнечной хиджры  отправляется в город Кум и начинает заниматься усовершенствованием среднего курса обучения.

   Оставшуюся часть книги «Фараид аль-усул» он изучает около покойного аятоллы Хадж Мирза Мухаммад Муджахиди Табризи (1327 – 1380 луной хиджры) и аятоллы Хадж Мирза Ахмад Кафи (1318 - 1412 лунной хиджры) и книгу «Кифаят аль-усул» изучает около покойного великого аятоллы Гулпайгани (1414 год лунной хиджры).

   После окончания высшей степени обучения в 1369 году лунной хиджры он начинает посещать уроки «Харидж» по фикху и науке «Усул» и извлек много пользы от таких великих ученых, как:

   1 - покойный и великий атолла Буруджерди (1292 – 1380 лунной хиджры), который преподавал в то время темы о намазе.

   2 – покойный и великий аятолла Хадж Сейид Мухаммад Худжат Кухкамери (1301 – 1373 лунной хиджры), который в то время начал преподавать уроки Харидж по темам купли – продажи.

   3 – покойный и великий аятолла имам Хомейни (1320 - 1409 лунной хиджры), который в то время преподавал тему «Истисхаб».

   До окончания первого цикла уроков по науке «Усул» имама Хомейни, он начал присутствовать на его уроках и тогда решил записать в точности все его уроки. Это занятие длилось около семи лет (1330 – 1337 год солнечной хиджры) и в то же время оно издалось.

   Аятолла Джафар Субхани в областях философии и науки «Калам» извлек большую пользу от покойного аятоллы Хадж Сейид Мухаммад Бадкубеи, который толковал книгу «Каваид аль-акаид».

   В научном центре Кума свои изучения по философии усовершенствовал с принятием участия на уроках логики и философии его светлости выдающегося аятоллы Сейид Мухаммад Хусейн Табатабаи и в 1327 года до 1330 года лунной хиджры аятолла Джафар Субхани изучил около него большую часть книги «Асфар».

   Также одновременно обучаясь, он начал преподавать первоначальные уроки и после того, как пришел в научный центр города Кума, продолжил свою преподавательскую деятельность. После некоторого времени начал преподавать средний курс обучения.

   Аятолла Джафар Субхани в течении около семи лет преподал книгу «Мутаввал», несколько циклов уроков по книге «Маалим» и «Лум¢атейн», семь циклов книги «Фараид» Шейха Ансари (в течении 21 года), несколько циклов по книге «Макасиб» и «Кифая» и пять раз толкование книги «Манзума».

   С 1394 года лунной хиджры (1353 год оп солнечной хиджре) он начинает преподавать уроки «Харидж» по фикху и науке «Усул», которые продолжаются и по сегодняшний день.

   Аятолла Джафар Субхани кроме преподавания фикха, науки «Усул» и философии, также в научном центре многочисленные годы занят преподаванием исламской идеологии, науки «Риджал», «Дирая», истории Ислама и шиизма, «Милал ва нихал», толкованием Корана  и литературой. Аятолла Джафар Субахани в каждой из этих наук имеет полезные и многочисленные произведения, которых преподал исламскому обществу.

   С самого начала открытия журнала «Исламская школа», которую он возглавляет, разнообразные вопросы со стороны молодежи и студентов задаются вопросы и аятолла Джафар Субхани имеет главу в журнале, которая называется «Вопросы и ответы», отвечающая на научные и религиозные вопросы.

   Аятолла Джафар Субхани в 1360 году солнечной хиджры открыл исследовательскую и учебную организацию «Имам Садык (а)», чтобы собрать специальную библиотеку исследования и писателей, к которой после некоторого времени прибавились и другие отделы, одним из которых является организование области для специалистов исламской идеологии. Этот отдел также возглавляет аятолла Джафар Субхани.

   Также посредством его, издается специальный журнал «Исламская идеология», которая является новым разделом в научных журналах.